MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013203	CAT	2	6	195570	195575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013203	GC	3	6	195577	195582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_013203	TGT	2	6	195590	195595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013203	GCA	2	6	195603	195608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013203	T	6	6	195697	195702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013203	A	6	6	195740	195745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013203	GAA	2	6	195757	195762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013203	T	7	7	195799	195805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013203	AATG	2	8	195834	195841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013203	ATAA	2	8	195868	195875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013203	GTTC	2	8	195995	196002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_013203	GC	3	6	196027	196032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_013203	TTG	2	6	196036	196041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013203	AATG	2	8	197567	197574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013203	TG	3	6	197664	197669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013203	GC	3	6	198010	198015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013203	GCG	2	6	198024	198029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013203	CGC	2	6	198038	198043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_013203	GAA	2	6	199877	199882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013203	CCA	2	6	199963	199968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_013203	CCG	2	6	200129	200134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_013203	CTA	2	6	200157	200162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013203	CG	3	6	200261	200266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_013203	TTTA	2	8	201331	201338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013203	CTT	2	6	201353	201358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013203	ATC	2	6	201504	201509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013203	TAA	2	6	201520	201525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013203	GAA	2	6	201547	201552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013203	TGAT	2	8	201879	201886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013203	TAA	2	6	201897	201902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013203	T	6	6	201945	201950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013203	TTAG	2	8	201955	201962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013203	AAAT	2	8	204831	204838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013203	ATT	2	6	204850	204855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013203	ATA	2	6	204866	204871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013203	TGT	2	6	204923	204928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013203	ACTTT	2	10	206946	206955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
538	NC_013203	CCAC	2	8	207019	207026	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
539	NC_013203	GA	3	6	208381	208386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013203	ATT	2	6	208435	208440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013203	CAA	2	6	208462	208467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013203	GTTT	2	8	209519	209526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013203	TAA	2	6	209609	209614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013203	TGGG	2	8	209652	209659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013203	AAT	2	6	209707	209712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013203	ATA	2	6	209727	209732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013203	T	6	6	209749	209754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013203	AAG	2	6	209851	209856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013203	GCC	2	6	214485	214490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_013203	TG	3	6	214629	214634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013203	GGA	2	6	215049	215054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013203	T	6	6	216748	216753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013203	ACC	2	6	216756	216761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_013203	AGA	2	6	216776	216781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013203	A	6	6	216796	216801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013203	TGC	2	6	216810	216815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013203	ATT	2	6	216884	216889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013203	GTC	2	6	216891	216896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013203	GACTGC	2	12	216937	216948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013203	ACTGCT	2	12	216962	216973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013203	GTCC	2	8	216980	216987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_013203	AGGAG	2	10	217025	217034	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013203	CA	4	8	218430	218437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_013203	GTAACC	2	12	218481	218492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013203	CAA	2	6	219584	219589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013203	TCT	2	6	219629	219634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013203	TG	3	6	219645	219650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013203	GTG	2	6	219655	219660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013203	TGT	2	6	219676	219681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013203	CTA	2	6	221472	221477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013203	AAAC	2	8	221508	221515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_013203	A	6	6	221523	221528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013203	CAA	2	6	221538	221543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013203	TTA	2	6	221557	221562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013203	AT	3	6	223198	223203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013203	TTTG	2	8	223255	223262	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013203	AAG	2	6	223271	223276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013203	TAT	2	6	223325	223330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013203	ATT	2	6	225051	225056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013203	ATT	2	6	225058	225063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013203	A	6	6	225115	225120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013203	AAT	2	6	225144	225149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013203	CTG	2	6	225171	225176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013203	TTA	2	6	226078	226083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013203	AGTAA	2	10	226151	226160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013203	ATT	2	6	226184	226189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013203	T	6	6	226188	226193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013203	ATT	2	6	226213	226218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013203	CATC	2	8	226262	226269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_013203	GAT	2	6	226278	226283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013203	AAG	2	6	226300	226305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013203	TGC	2	6	226309	226314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013203	TCT	2	6	226340	226345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013203	AAT	2	6	226372	226377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013203	TGA	3	9	226462	226470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013203	ATT	2	6	226532	226537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013203	A	6	6	226541	226546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013203	ATT	2	6	226592	226597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013203	ACTA	2	8	226745	226752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_013203	TTA	2	6	226756	226761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013203	ATT	2	6	226899	226904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013203	GAT	2	6	226908	226913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013203	CTT	2	6	226934	226939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013203	AAG	3	9	227029	227037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013203	TGG	2	6	227059	227064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013203	AAC	2	6	227065	227070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013203	TTG	2	6	227127	227132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013203	A	8	8	227219	227226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013203	GAT	3	9	227264	227272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013203	TAA	2	6	227287	227292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013203	T	6	6	227331	227336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013203	ATTT	2	8	230053	230060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013203	GTG	2	6	230229	230234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013203	T	6	6	230459	230464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013203	CAC	2	6	230510	230515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_013203	CAT	2	6	231344	231349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013203	GAAG	2	8	231461	231468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013203	CAA	2	6	231486	231491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013203	TTC	2	6	231506	231511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013203	TGTC	2	8	231514	231521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_013203	GCTTT	2	10	231527	231536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
622	NC_013203	GGAC	2	8	231605	231612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_013203	TGC	2	6	231618	231623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013203	AAC	2	6	231652	231657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013203	TACT	2	8	231734	231741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013203	CTGC	2	8	231779	231786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013203	TCA	2	6	231914	231919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013203	GTTG	2	8	232002	232009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013203	AGT	2	6	232146	232151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013203	GAA	2	6	232155	232160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013203	ACA	2	6	232272	232277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013203	CTTGAG	2	12	232297	232308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
633	NC_013203	TCA	2	6	232325	232330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013203	CTCG	2	8	232476	232483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_013203	GTTC	2	8	232521	232528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_013203	CAGG	2	8	233544	233551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_013203	GCGG	2	8	233555	233562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
638	NC_013203	TGG	2	6	239690	239695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013203	CTC	2	6	240312	240317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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962	NC_013203	T	6	6	371714	371719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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972	NC_013203	T	6	6	373069	373074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
973	NC_013203	ATAA	2	8	373116	373123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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